1943年5月14日被下令编成，但由于原先预定编入第30师团的步兵第41联队（原第5师团的福山联队）被编入南海支队，前往东部巴布亚新几内亚的奥恩斯坦利山脉的原因。第30师团始终以2个步兵联队的编制在平壤待命。
步兵第41联队在奥恩斯坦利山脉与美军持续交战直到1944年2月才正式编入第30师团的建制。4月中旬第30师团到达菲律宾棉蘭老島，担任岛北部的防御。8月，被编入负责菲律宾南部防御任务的第35軍（指挥官为铃木宗作中将）麾下。负责菲律宾和棉兰老岛的守备任务。1944年10月12日，雷伊泰島戰役爆发，先期投入的第41联队的2个大队以及12月投入另外2个大队均在美军的攻势下全军覆没，之后师团主力在棉蘭老島戰役中，在没有援兵且补给被切断的情况下进行持久作战，直到终战。